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代谢组学检测中的长链非编码RNA实验过程解析

长非编码RNA(LncRNAs)因其在生理和环境中的意义而被广泛研究,但其在代谢中的功能和治疗潜力还远未阐明。本文就lncRNAs的识别、功能、作为生物标志物的作用以及在代谢中的治疗前景等方面的研究进展作一综述。


最初将非编码基因组定义为垃圾DNA是不可能的,因为基因组中这一重要部分的潜在功能是无穷无尽的。LncRNA被定义为长度超过200bp的ncRNA分子,其在基因表达调控中的折衷作用现在被赋予了至关重要的相关。lncrna在哺乳动物不同的发育阶段具有不同的富集程度,具有特定的时空表达模式。此外,它们并不总是普遍存在于人体中,越来越多的器官和线条特异的lncRNA已经被识别出来。据报道,lncRNA在脂肪生成和代谢中都起作用,从肥胖到2型糖尿病、心血管(Cvd)、骨关节炎、高血压、肝脏代谢和血脂异常。


代谢检测中的长链非编码RNA实验过程解析图

高通量筛查的最大优势之一是有可能识别出新的候选。这些筛查研究中,当在人体上进行时,都是在体液上进行的,很容易在没有侵入技术的情况下取回。在这一领域,最重要的进展是心血管。当在ClinicalTrials.gov数据库中搜索术语lncRNA和生物标记物时,出现了24项研究。其中8例与代谢有关,5例与心血管有关(NCT04175691、NCT04230785、NCT03268135、NCT02915315和NCT03225183),各1例与糖尿病周围神经病变(NCT04638556)、慢肾病(NCT02304471)和骨关节炎(NCT03726918)有关。此外,rna-seq研究的结果还可能导致确定其他相关的代谢的生物标志物,目前正在开发计算方法,以便将与相关的lncRNA识别为潜在的生物标志物和可能的治疗靶点。


代谢组学检测中的长链非编码RNA实验过程解析图2

代谢治疗的新进展集中在RNA作为药理学试剂和靶点的潜力上。单链寡核苷酸疗法已被批准用于治疗家族代谢,包括纯合子家族高胆固醇血症、家族乳糜微粒血症、高甘油三酯血症、家族部分脂营养不良和遗传转甲状腺素介导的淀粉样变。目前还没有针对代谢的lncRNAs的批准药物或正在进行的临床试验,但随着反义寡核苷酸(Aso),如GapmeRs,已被发现可以调节与心肌梗死有关的lncRNAs,例如meg3,正在取得进展。一个关键的方面涉及后续治疗的lncRNA递送策略。原则上,用于传递mRNAs的相同方法(例如,ASO传递)可以应用于对lncRNAs的管理。值得注意的是,先进的技术使得通过几乎任何管理途径提供ASO成为可能,无论是系统的还是本地的。例如:鞘内注射nusinersen治疗脊髓肌萎缩,玻璃体内注射fomivirsen治疗巨细胞病毒视网膜炎,气雾剂治疗IONIS-ENAC-2.5Rxin囊纤维化,皮内注射PF-06473871治疗皮肤瘢痕,甚至直肠注射alicaforsen治疗慢袋炎。大量ASO已进入心血管和代谢的临床试验,主要是皮下或静脉给药。尽管如此,有关ASOS传递的关键方面仍需考虑和改进,包括加强ASOS与靶RNA序列的结合、提高其稳定、提高生物利用度和药代动力学参数。这将提高它们的疗效并减少不良反应。



 


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